Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Pggt1bQ8BUY9 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms