Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cpne9Q1RLL3 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms