Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sh3bp1P55194 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms