Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RxraP28700 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RxraP28700 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RxraP28700 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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