Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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