Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Cldn4O35054 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn4O35054 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn4O35054 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn4O35054 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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