Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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