Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.1 ms