Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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Chmp3Q9CQ10 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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Chmp3Q9CQ10 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Chmp3Q9CQ10 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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Chmp3Q9CQ10 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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Chmp3Q9CQ10 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
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