Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Bco2Q99NF1 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Bco2Q99NF1 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Bco2Q99NF1 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Bco2Q99NF1 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Bco2Q99NF1 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms