Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ubash3bQ8BGG7 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms