Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc18Q640L5 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc18Q640L5 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc18Q640L5 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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