Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cln5Q3UMW8 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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