Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ssbp4Q3U4B1 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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