Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms