Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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