Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm21887J3QQ04 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm21887J3QQ04 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms