Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Usp9yF8VPU6 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Usp9yF8VPU6 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Usp9yF8VPU6 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Usp9yF8VPU6 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Usp9yF8VPU6 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Usp9yF8VPU6 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Usp9yF8VPU6 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms