Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ApobE9Q414 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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