Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.7 ms