Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3550W4VSN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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