Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc166S4R181 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms