Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcniQ9Z2V9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcniQ9Z2V9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms