Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac5Q9Z2V6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms