Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt16Q9Z2K1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms