Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms