Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka4Q9Z2B9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms