Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms