Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpcQ9Z204 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpcQ9Z204 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms