Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms