Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap3b1Q9Z1T1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap3b1Q9Z1T1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms