Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VarsQ9Z1Q9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms