Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms