Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms