Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms