Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20bQ9Z104 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms