Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms