Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AireQ9Z0E3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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AireQ9Z0E3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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AireQ9Z0E3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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AireQ9Z0E3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AireQ9Z0E3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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