Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms