Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms