Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni1Q9WUZ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni1Q9WUZ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms