Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srd5a3Q9WUP4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms