Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx9Q9WUH2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms