Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lemd3Q9WU40 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms