Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms