Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms