Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TapbpQ9R233 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms