Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfebQ9R210 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfebQ9R210 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms