Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sorbs3Q9R1Z8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sorbs3Q9R1Z8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms