Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7Q9R1C0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms